Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HERC6Q8IVU3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HERC6Q8IVU3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HERC6Q8IVU3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC6Q8IVU3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC6Q8IVU3 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC6Q8IVU3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC6Q8IVU3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC6Q8IVU3 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HERC6Q8IVU3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC6Q8IVU3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC6Q8IVU3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC6Q8IVU3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC6Q8IVU3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HERC6Q8IVU3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERC6Q8IVU3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERC6Q8IVU3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERC6Q8IVU3 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HERC6Q8IVU3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HERC6Q8IVU3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HERC6Q8IVU3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERC6Q8IVU3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERC6Q8IVU3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERC6Q8IVU3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HERC6Q8IVU3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERC6Q8IVU3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERC6Q8IVU3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERC6Q8IVU3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERC6Q8IVU3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERC6Q8IVU3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HERC6Q8IVU3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HERC6Q8IVU3 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HERC6Q8IVU3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HERC6Q8IVU3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERC6Q8IVU3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HERC6Q8IVU3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERC6Q8IVU3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HERC6Q8IVU3 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERC6Q8IVU3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERC6Q8IVU3 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERC6Q8IVU3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERC6Q8IVU3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HERC6Q8IVU3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC6Q8IVU3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC6Q8IVU3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC6Q8IVU3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC6Q8IVU3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC6Q8IVU3 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC6Q8IVU3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC6Q8IVU3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC6Q8IVU3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC6Q8IVU3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HERC6Q8IVU3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HERC6Q8IVU3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms