Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE2Q1Q7Z7E8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
UBE2Q1Q7Z7E8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE2Q1Q7Z7E8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE2Q1Q7Z7E8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE2Q1Q7Z7E8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE2Q1Q7Z7E8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE2Q1Q7Z7E8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE2Q1Q7Z7E8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE2Q1Q7Z7E8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
UBE2Q1Q7Z7E8 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE2Q1Q7Z7E8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE2Q1Q7Z7E8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
UBE2Q1Q7Z7E8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE2Q1Q7Z7E8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE2Q1Q7Z7E8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE2Q1Q7Z7E8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE2Q1Q7Z7E8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
UBE2Q1Q7Z7E8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE2Q1Q7Z7E8 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE2Q1Q7Z7E8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE2Q1Q7Z7E8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
UBE2Q1Q7Z7E8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE2Q1Q7Z7E8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE2Q1Q7Z7E8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE2Q1Q7Z7E8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE2Q1Q7Z7E8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE2Q1Q7Z7E8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
UBE2Q1Q7Z7E8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE2Q1Q7Z7E8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE2Q1Q7Z7E8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE2Q1Q7Z7E8 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE2Q1Q7Z7E8 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE2Q1Q7Z7E8 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
UBE2Q1Q7Z7E8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE2Q1Q7Z7E8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
UBE2Q1Q7Z7E8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE2Q1Q7Z7E8 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE2Q1Q7Z7E8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
UBE2Q1Q7Z7E8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE2Q1Q7Z7E8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE2Q1Q7Z7E8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE2Q1Q7Z7E8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE2Q1Q7Z7E8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE2Q1Q7Z7E8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
UBE2Q1Q7Z7E8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE2Q1Q7Z7E8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
UBE2Q1Q7Z7E8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
UBE2Q1Q7Z7E8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE2Q1Q7Z7E8 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE2Q1Q7Z7E8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE2Q1Q7Z7E8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE2Q1Q7Z7E8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
UBE2Q1Q7Z7E8 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
UBE2Q1Q7Z7E8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE2Q1Q7Z7E8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE2Q1Q7Z7E8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE2Q1Q7Z7E8 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE2Q1Q7Z7E8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE2Q1Q7Z7E8 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
UBE2Q1Q7Z7E8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE2Q1Q7Z7E8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE2Q1Q7Z7E8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE2Q1Q7Z7E8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
UBE2Q1Q7Z7E8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE2Q1Q7Z7E8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE2Q1Q7Z7E8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE2Q1Q7Z7E8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
UBE2Q1Q7Z7E8 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE2Q1Q7Z7E8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE2Q1Q7Z7E8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE2Q1Q7Z7E8 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
UBE2Q1Q7Z7E8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
UBE2Q1Q7Z7E8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE2Q1Q7Z7E8 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE2Q1Q7Z7E8 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
UBE2Q1Q7Z7E8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE2Q1Q7Z7E8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE2Q1Q7Z7E8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE2Q1Q7Z7E8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE2Q1Q7Z7E8 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE2Q1Q7Z7E8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE2Q1Q7Z7E8 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
UBE2Q1Q7Z7E8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE2Q1Q7Z7E8 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE2Q1Q7Z7E8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE2Q1Q7Z7E8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE2Q1Q7Z7E8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
UBE2Q1Q7Z7E8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE2Q1Q7Z7E8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE2Q1Q7Z7E8 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
UBE2Q1Q7Z7E8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms