Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
OTOP1Q7RTM1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.54■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.53■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.53■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.52■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
OTOP1Q7RTM1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
OTOP1Q7RTM1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
OTOP1Q7RTM1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
OTOP1Q7RTM1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
OTOP1Q7RTM1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
OTOP1Q7RTM1 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
OTOP1Q7RTM1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
OTOP1Q7RTM1 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
OTOP1Q7RTM1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
OTOP1Q7RTM1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
OTOP1Q7RTM1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
OTOP1Q7RTM1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
OTOP1Q7RTM1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
OTOP1Q7RTM1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
OTOP1Q7RTM1 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
OTOP1Q7RTM1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
OTOP1Q7RTM1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
OTOP1Q7RTM1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
OTOP1Q7RTM1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
OTOP1Q7RTM1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
OTOP1Q7RTM1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms