Protein–RNA interactions for Protein: Q70SY1

CREB3L2, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L2Q70SY1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L2Q70SY1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L2Q70SY1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L2Q70SY1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CREB3L2Q70SY1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3L2Q70SY1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3L2Q70SY1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CREB3L2Q70SY1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3L2Q70SY1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3L2Q70SY1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3L2Q70SY1 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CREB3L2Q70SY1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L2Q70SY1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L2Q70SY1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L2Q70SY1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L2Q70SY1 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L2Q70SY1 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L2Q70SY1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L2Q70SY1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CREB3L2Q70SY1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L2Q70SY1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L2Q70SY1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L2Q70SY1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L2Q70SY1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L2Q70SY1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L2Q70SY1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CREB3L2Q70SY1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L2Q70SY1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L2Q70SY1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L2Q70SY1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L2Q70SY1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L2Q70SY1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L2Q70SY1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L2Q70SY1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CREB3L2Q70SY1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CREB3L2Q70SY1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3L2Q70SY1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3L2Q70SY1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3L2Q70SY1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3L2Q70SY1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3L2Q70SY1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3L2Q70SY1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3L2Q70SY1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3L2Q70SY1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3L2Q70SY1 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3L2Q70SY1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3L2Q70SY1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3L2Q70SY1 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3L2Q70SY1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CREB3L2Q70SY1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms