Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
VITQ6UXI7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VITQ6UXI7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VITQ6UXI7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VITQ6UXI7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VITQ6UXI7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VITQ6UXI7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VITQ6UXI7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
VITQ6UXI7 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VITQ6UXI7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VITQ6UXI7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VITQ6UXI7 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VITQ6UXI7 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VITQ6UXI7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VITQ6UXI7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VITQ6UXI7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VITQ6UXI7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VITQ6UXI7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
VITQ6UXI7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
VITQ6UXI7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VITQ6UXI7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VITQ6UXI7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VITQ6UXI7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VITQ6UXI7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VITQ6UXI7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VITQ6UXI7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VITQ6UXI7 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VITQ6UXI7 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms