Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIF2

SYCE2, Synaptonemal complex central element protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCE2Q6PIF2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCE2Q6PIF2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCE2Q6PIF2 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCE2Q6PIF2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYCE2Q6PIF2 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCE2Q6PIF2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCE2Q6PIF2 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCE2Q6PIF2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCE2Q6PIF2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCE2Q6PIF2 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SYCE2Q6PIF2 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCE2Q6PIF2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCE2Q6PIF2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCE2Q6PIF2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYCE2Q6PIF2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCE2Q6PIF2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCE2Q6PIF2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCE2Q6PIF2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCE2Q6PIF2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCE2Q6PIF2 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCE2Q6PIF2 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCE2Q6PIF2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCE2Q6PIF2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCE2Q6PIF2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYCE2Q6PIF2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCE2Q6PIF2 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCE2Q6PIF2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SYCE2Q6PIF2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCE2Q6PIF2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCE2Q6PIF2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCE2Q6PIF2 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYCE2Q6PIF2 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE2Q6PIF2 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE2Q6PIF2 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE2Q6PIF2 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE2Q6PIF2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE2Q6PIF2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE2Q6PIF2 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYCE2Q6PIF2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCE2Q6PIF2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCE2Q6PIF2 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCE2Q6PIF2 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCE2Q6PIF2 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCE2Q6PIF2 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCE2Q6PIF2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCE2Q6PIF2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYCE2Q6PIF2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYCE2Q6PIF2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYCE2Q6PIF2 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms