Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EMBQ6PCB8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EMBQ6PCB8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EMBQ6PCB8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms