Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4A7

SFXN4, Sideroflexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFXN4Q6P4A7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
SFXN4Q6P4A7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SFXN4Q6P4A7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFXN4Q6P4A7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFXN4Q6P4A7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SFXN4Q6P4A7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFXN4Q6P4A7 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SFXN4Q6P4A7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFXN4Q6P4A7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFXN4Q6P4A7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFXN4Q6P4A7 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SFXN4Q6P4A7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SFXN4Q6P4A7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms