Protein–RNA interactions for Protein: Q6JBY9

RCSD1, CapZ-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1Q6JBY9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RCSD1Q6JBY9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
RCSD1Q6JBY9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RCSD1Q6JBY9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RCSD1Q6JBY9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RCSD1Q6JBY9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RCSD1Q6JBY9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RCSD1Q6JBY9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RCSD1Q6JBY9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RCSD1Q6JBY9 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RCSD1Q6JBY9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RCSD1Q6JBY9 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RCSD1Q6JBY9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RCSD1Q6JBY9 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RCSD1Q6JBY9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RCSD1Q6JBY9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RCSD1Q6JBY9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RCSD1Q6JBY9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RCSD1Q6JBY9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RCSD1Q6JBY9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RCSD1Q6JBY9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RCSD1Q6JBY9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RCSD1Q6JBY9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RCSD1Q6JBY9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RCSD1Q6JBY9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RCSD1Q6JBY9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RCSD1Q6JBY9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RCSD1Q6JBY9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RCSD1Q6JBY9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RCSD1Q6JBY9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RCSD1Q6JBY9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RCSD1Q6JBY9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RCSD1Q6JBY9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RCSD1Q6JBY9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RCSD1Q6JBY9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RCSD1Q6JBY9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RCSD1Q6JBY9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RCSD1Q6JBY9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RCSD1Q6JBY9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RCSD1Q6JBY9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RCSD1Q6JBY9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
RCSD1Q6JBY9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RCSD1Q6JBY9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RCSD1Q6JBY9 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RCSD1Q6JBY9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RCSD1Q6JBY9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RCSD1Q6JBY9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RCSD1Q6JBY9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RCSD1Q6JBY9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RCSD1Q6JBY9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RCSD1Q6JBY9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RCSD1Q6JBY9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RCSD1Q6JBY9 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RCSD1Q6JBY9 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RCSD1Q6JBY9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RCSD1Q6JBY9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RCSD1Q6JBY9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RCSD1Q6JBY9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RCSD1Q6JBY9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RCSD1Q6JBY9 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RCSD1Q6JBY9 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RCSD1Q6JBY9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RCSD1Q6JBY9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RCSD1Q6JBY9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RCSD1Q6JBY9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCSD1Q6JBY9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCSD1Q6JBY9 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCSD1Q6JBY9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCSD1Q6JBY9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RCSD1Q6JBY9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCSD1Q6JBY9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RCSD1Q6JBY9 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCSD1Q6JBY9 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCSD1Q6JBY9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RCSD1Q6JBY9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCSD1Q6JBY9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCSD1Q6JBY9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCSD1Q6JBY9 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCSD1Q6JBY9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCSD1Q6JBY9 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RCSD1Q6JBY9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RCSD1Q6JBY9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RCSD1Q6JBY9 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RCSD1Q6JBY9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RCSD1Q6JBY9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
RCSD1Q6JBY9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RCSD1Q6JBY9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RCSD1Q6JBY9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RCSD1Q6JBY9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RCSD1Q6JBY9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms