Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LARP1BQ659C4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LARP1BQ659C4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
LARP1BQ659C4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LARP1BQ659C4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LARP1BQ659C4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LARP1BQ659C4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LARP1BQ659C4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LARP1BQ659C4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LARP1BQ659C4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LARP1BQ659C4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LARP1BQ659C4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LARP1BQ659C4 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LARP1BQ659C4 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LARP1BQ659C4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LARP1BQ659C4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LARP1BQ659C4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARP1BQ659C4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARP1BQ659C4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARP1BQ659C4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARP1BQ659C4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LARP1BQ659C4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LARP1BQ659C4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LARP1BQ659C4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LARP1BQ659C4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LARP1BQ659C4 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LARP1BQ659C4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LARP1BQ659C4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LARP1BQ659C4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LARP1BQ659C4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LARP1BQ659C4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LARP1BQ659C4 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LARP1BQ659C4 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LARP1BQ659C4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LARP1BQ659C4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
LARP1BQ659C4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms