Protein–RNA interactions for Protein: Q5W186

CST9, Cystatin-9, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST9Q5W186 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CST9Q5W186 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CST9Q5W186 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CST9Q5W186 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CST9Q5W186 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CST9Q5W186 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CST9Q5W186 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CST9Q5W186 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CST9Q5W186 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CST9Q5W186 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CST9Q5W186 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CST9Q5W186 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CST9Q5W186 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CST9Q5W186 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CST9Q5W186 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CST9Q5W186 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CST9Q5W186 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CST9Q5W186 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CST9Q5W186 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CST9Q5W186 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CST9Q5W186 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CST9Q5W186 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CST9Q5W186 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CST9Q5W186 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CST9Q5W186 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CST9Q5W186 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CST9Q5W186 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CST9Q5W186 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CST9Q5W186 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CST9Q5W186 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CST9Q5W186 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CST9Q5W186 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CST9Q5W186 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CST9Q5W186 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CST9Q5W186 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CST9Q5W186 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CST9Q5W186 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CST9Q5W186 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CST9Q5W186 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CST9Q5W186 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CST9Q5W186 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CST9Q5W186 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CST9Q5W186 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CST9Q5W186 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CST9Q5W186 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CST9Q5W186 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CST9Q5W186 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CST9Q5W186 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CST9Q5W186 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CST9Q5W186 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CST9Q5W186 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CST9Q5W186 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CST9Q5W186 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CST9Q5W186 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CST9Q5W186 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CST9Q5W186 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CST9Q5W186 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CST9Q5W186 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CST9Q5W186 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CST9Q5W186 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CST9Q5W186 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CST9Q5W186 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CST9Q5W186 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CST9Q5W186 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CST9Q5W186 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CST9Q5W186 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CST9Q5W186 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CST9Q5W186 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CST9Q5W186 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CST9Q5W186 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CST9Q5W186 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CST9Q5W186 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CST9Q5W186 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CST9Q5W186 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CST9Q5W186 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CST9Q5W186 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CST9Q5W186 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CST9Q5W186 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CST9Q5W186 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CST9Q5W186 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CST9Q5W186 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CST9Q5W186 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CST9Q5W186 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CST9Q5W186 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CST9Q5W186 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CST9Q5W186 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CST9Q5W186 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CST9Q5W186 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CST9Q5W186 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CST9Q5W186 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CST9Q5W186 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CST9Q5W186 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CST9Q5W186 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CST9Q5W186 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CST9Q5W186 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CST9Q5W186 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CST9Q5W186 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CST9Q5W186 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CST9Q5W186 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CST9Q5W186 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms