Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BROXQ5VW32 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
BROXQ5VW32 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BROXQ5VW32 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms