Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GKAP1Q5VSY0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
GKAP1Q5VSY0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GKAP1Q5VSY0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms