Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SOGA3Q5TF21 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SOGA3Q5TF21 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SOGA3Q5TF21 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SOGA3Q5TF21 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SOGA3Q5TF21 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SOGA3Q5TF21 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SOGA3Q5TF21 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SOGA3Q5TF21 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SOGA3Q5TF21 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SOGA3Q5TF21 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SOGA3Q5TF21 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
SOGA3Q5TF21 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SOGA3Q5TF21 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SOGA3Q5TF21 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SOGA3Q5TF21 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SOGA3Q5TF21 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SOGA3Q5TF21 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SOGA3Q5TF21 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SOGA3Q5TF21 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SOGA3Q5TF21 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
SOGA3Q5TF21 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SOGA3Q5TF21 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SOGA3Q5TF21 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SOGA3Q5TF21 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SOGA3Q5TF21 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SOGA3Q5TF21 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SOGA3Q5TF21 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SOGA3Q5TF21 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SOGA3Q5TF21 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
SOGA3Q5TF21 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SOGA3Q5TF21 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SOGA3Q5TF21 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SOGA3Q5TF21 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SOGA3Q5TF21 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
SOGA3Q5TF21 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
SOGA3Q5TF21 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SOGA3Q5TF21 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
SOGA3Q5TF21 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SOGA3Q5TF21 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SOGA3Q5TF21 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SOGA3Q5TF21 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
SOGA3Q5TF21 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SOGA3Q5TF21 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
SOGA3Q5TF21 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SOGA3Q5TF21 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
SOGA3Q5TF21 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
SOGA3Q5TF21 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SOGA3Q5TF21 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SOGA3Q5TF21 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
SOGA3Q5TF21 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SOGA3Q5TF21 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SOGA3Q5TF21 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SOGA3Q5TF21 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SOGA3Q5TF21 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SOGA3Q5TF21 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
SOGA3Q5TF21 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SOGA3Q5TF21 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SOGA3Q5TF21 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
SOGA3Q5TF21 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SOGA3Q5TF21 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms