Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LDLRAD1Q5T700 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LDLRAD1Q5T700 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LDLRAD1Q5T700 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LDLRAD1Q5T700 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
LDLRAD1Q5T700 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LDLRAD1Q5T700 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LDLRAD1Q5T700 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LDLRAD1Q5T700 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
LDLRAD1Q5T700 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LDLRAD1Q5T700 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LDLRAD1Q5T700 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LDLRAD1Q5T700 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LDLRAD1Q5T700 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LDLRAD1Q5T700 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LDLRAD1Q5T700 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LDLRAD1Q5T700 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LDLRAD1Q5T700 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LDLRAD1Q5T700 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LDLRAD1Q5T700 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LDLRAD1Q5T700 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
LDLRAD1Q5T700 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LDLRAD1Q5T700 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LDLRAD1Q5T700 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LDLRAD1Q5T700 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
LDLRAD1Q5T700 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LDLRAD1Q5T700 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LDLRAD1Q5T700 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LDLRAD1Q5T700 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LDLRAD1Q5T700 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LDLRAD1Q5T700 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
LDLRAD1Q5T700 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LDLRAD1Q5T700 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LDLRAD1Q5T700 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LDLRAD1Q5T700 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LDLRAD1Q5T700 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LDLRAD1Q5T700 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LDLRAD1Q5T700 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LDLRAD1Q5T700 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LDLRAD1Q5T700 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LDLRAD1Q5T700 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LDLRAD1Q5T700 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LDLRAD1Q5T700 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LDLRAD1Q5T700 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LDLRAD1Q5T700 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LDLRAD1Q5T700 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LDLRAD1Q5T700 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LDLRAD1Q5T700 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LDLRAD1Q5T700 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LDLRAD1Q5T700 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
LDLRAD1Q5T700 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LDLRAD1Q5T700 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LDLRAD1Q5T700 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LDLRAD1Q5T700 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LDLRAD1Q5T700 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LDLRAD1Q5T700 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LDLRAD1Q5T700 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LDLRAD1Q5T700 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LDLRAD1Q5T700 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
LDLRAD1Q5T700 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LDLRAD1Q5T700 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LDLRAD1Q5T700 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LDLRAD1Q5T700 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LDLRAD1Q5T700 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LDLRAD1Q5T700 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
LDLRAD1Q5T700 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LDLRAD1Q5T700 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LDLRAD1Q5T700 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LDLRAD1Q5T700 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LDLRAD1Q5T700 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LDLRAD1Q5T700 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LDLRAD1Q5T700 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LDLRAD1Q5T700 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LDLRAD1Q5T700 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LDLRAD1Q5T700 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LDLRAD1Q5T700 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LDLRAD1Q5T700 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LDLRAD1Q5T700 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LDLRAD1Q5T700 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
LDLRAD1Q5T700 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LDLRAD1Q5T700 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LDLRAD1Q5T700 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LDLRAD1Q5T700 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LDLRAD1Q5T700 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LDLRAD1Q5T700 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LDLRAD1Q5T700 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LDLRAD1Q5T700 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LDLRAD1Q5T700 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LDLRAD1Q5T700 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LDLRAD1Q5T700 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LDLRAD1Q5T700 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LDLRAD1Q5T700 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LDLRAD1Q5T700 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LDLRAD1Q5T700 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms