Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC92Q53HC0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC92Q53HC0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC92Q53HC0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms