Protein–RNA interactions for Protein: Q16763

UBE2S, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 S, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2SQ16763 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE2SQ16763 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBE2SQ16763 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE2SQ16763 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE2SQ16763 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
UBE2SQ16763 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE2SQ16763 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE2SQ16763 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE2SQ16763 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE2SQ16763 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBE2SQ16763 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE2SQ16763 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE2SQ16763 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE2SQ16763 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE2SQ16763 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBE2SQ16763 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE2SQ16763 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE2SQ16763 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE2SQ16763 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBE2SQ16763 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE2SQ16763 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBE2SQ16763 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE2SQ16763 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE2SQ16763 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE2SQ16763 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE2SQ16763 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE2SQ16763 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE2SQ16763 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE2SQ16763 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
UBE2SQ16763 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
UBE2SQ16763 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE2SQ16763 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE2SQ16763 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE2SQ16763 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE2SQ16763 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
UBE2SQ16763 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE2SQ16763 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE2SQ16763 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE2SQ16763 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE2SQ16763 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE2SQ16763 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE2SQ16763 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE2SQ16763 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE2SQ16763 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE2SQ16763 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
UBE2SQ16763 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE2SQ16763 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE2SQ16763 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE2SQ16763 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
UBE2SQ16763 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE2SQ16763 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE2SQ16763 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE2SQ16763 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE2SQ16763 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE2SQ16763 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
UBE2SQ16763 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE2SQ16763 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE2SQ16763 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE2SQ16763 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE2SQ16763 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE2SQ16763 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
UBE2SQ16763 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms