Protein–RNA interactions for Protein: Q16650

TBR1, T-box brain protein 1, humanhuman

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBR1Q16650 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TBR1Q16650 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TBR1Q16650 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TBR1Q16650 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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