Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
GABRA6Q16445 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
GABRA6Q16445 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GABRA6Q16445 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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