Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
VPS72Q15906 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
VPS72Q15906 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
VPS72Q15906 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
VPS72Q15906 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
VPS72Q15906 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
VPS72Q15906 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
VPS72Q15906 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
VPS72Q15906 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
VPS72Q15906 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
VPS72Q15906 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
VPS72Q15906 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
VPS72Q15906 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
VPS72Q15906 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
VPS72Q15906 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
VPS72Q15906 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
VPS72Q15906 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
VPS72Q15906 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
VPS72Q15906 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
VPS72Q15906 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
VPS72Q15906 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
VPS72Q15906 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
VPS72Q15906 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
VPS72Q15906 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
VPS72Q15906 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
VPS72Q15906 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
VPS72Q15906 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
VPS72Q15906 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
VPS72Q15906 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
VPS72Q15906 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC31.7■■■□□ 2.67
VPS72Q15906 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
VPS72Q15906 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
VPS72Q15906 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
VPS72Q15906 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.68■■■□□ 2.66
VPS72Q15906 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
VPS72Q15906 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
VPS72Q15906 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
VPS72Q15906 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
VPS72Q15906 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
VPS72Q15906 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
VPS72Q15906 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
VPS72Q15906 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
VPS72Q15906 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
VPS72Q15906 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.66■■■□□ 2.66
VPS72Q15906 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
VPS72Q15906 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC31.65■■■□□ 2.66
VPS72Q15906 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
VPS72Q15906 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
VPS72Q15906 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
VPS72Q15906 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
VPS72Q15906 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
VPS72Q15906 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
VPS72Q15906 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
VPS72Q15906 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
VPS72Q15906 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
VPS72Q15906 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
VPS72Q15906 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
VPS72Q15906 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
VPS72Q15906 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
VPS72Q15906 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
VPS72Q15906 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
VPS72Q15906 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
VPS72Q15906 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
VPS72Q15906 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
VPS72Q15906 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
VPS72Q15906 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
VPS72Q15906 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
VPS72Q15906 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
VPS72Q15906 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
VPS72Q15906 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
VPS72Q15906 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
VPS72Q15906 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
VPS72Q15906 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
VPS72Q15906 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
VPS72Q15906 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
VPS72Q15906 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
VPS72Q15906 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
VPS72Q15906 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
VPS72Q15906 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
VPS72Q15906 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
VPS72Q15906 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
VPS72Q15906 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
VPS72Q15906 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
VPS72Q15906 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
VPS72Q15906 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
VPS72Q15906 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
VPS72Q15906 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
VPS72Q15906 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
VPS72Q15906 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
VPS72Q15906 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
VPS72Q15906 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
VPS72Q15906 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
VPS72Q15906 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
VPS72Q15906 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
VPS72Q15906 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
VPS72Q15906 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
VPS72Q15906 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
VPS72Q15906 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
VPS72Q15906 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
VPS72Q15906 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC31.53■■■□□ 2.64
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