Protein–RNA interactions for Protein: Q15796

SMAD2, Mothers against decapentaplegic homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD2Q15796 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAD2Q15796 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAD2Q15796 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMAD2Q15796 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD2Q15796 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD2Q15796 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD2Q15796 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD2Q15796 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD2Q15796 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD2Q15796 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMAD2Q15796 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD2Q15796 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD2Q15796 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD2Q15796 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMAD2Q15796 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAD2Q15796 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAD2Q15796 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAD2Q15796 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAD2Q15796 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAD2Q15796 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAD2Q15796 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAD2Q15796 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMAD2Q15796 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMAD2Q15796 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMAD2Q15796 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SMAD2Q15796 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMAD2Q15796 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SMAD2Q15796 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMAD2Q15796 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMAD2Q15796 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SMAD2Q15796 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD2Q15796 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD2Q15796 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD2Q15796 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMAD2Q15796 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD2Q15796 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD2Q15796 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD2Q15796 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD2Q15796 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD2Q15796 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD2Q15796 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD2Q15796 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD2Q15796 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SMAD2Q15796 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD2Q15796 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD2Q15796 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD2Q15796 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMAD2Q15796 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAD2Q15796 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAD2Q15796 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMAD2Q15796 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAD2Q15796 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAD2Q15796 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMAD2Q15796 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMAD2Q15796 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMAD2Q15796 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMAD2Q15796 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMAD2Q15796 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMAD2Q15796 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMAD2Q15796 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMAD2Q15796 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD2Q15796 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD2Q15796 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD2Q15796 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMAD2Q15796 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD2Q15796 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD2Q15796 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD2Q15796 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD2Q15796 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD2Q15796 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD2Q15796 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMAD2Q15796 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD2Q15796 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD2Q15796 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD2Q15796 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD2Q15796 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD2Q15796 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD2Q15796 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD2Q15796 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD2Q15796 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD2Q15796 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD2Q15796 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMAD2Q15796 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD2Q15796 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD2Q15796 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD2Q15796 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD2Q15796 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD2Q15796 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMAD2Q15796 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAD2Q15796 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMAD2Q15796 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAD2Q15796 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAD2Q15796 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMAD2Q15796 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMAD2Q15796 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD2Q15796 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD2Q15796 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD2Q15796 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD2Q15796 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMAD2Q15796 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms