Protein–RNA interactions for Protein: Q15345

LRRC41, Leucine-rich repeat-containing protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC41Q15345 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LRRC41Q15345 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRRC41Q15345 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC41Q15345 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC41Q15345 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC41Q15345 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC41Q15345 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC41Q15345 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC41Q15345 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC41Q15345 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC41Q15345 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC41Q15345 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC41Q15345 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC41Q15345 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC41Q15345 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC41Q15345 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC41Q15345 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms