Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CKAP5Q14008 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CKAP5Q14008 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CKAP5Q14008 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
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