Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

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Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNTA1Q13424 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNTA1Q13424 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNTA1Q13424 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNTA1Q13424 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SNTA1Q13424 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNTA1Q13424 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SNTA1Q13424 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNTA1Q13424 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SNTA1Q13424 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNTA1Q13424 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNTA1Q13424 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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