Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
PRDM2Q13029 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
PRDM2Q13029 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
PRDM2Q13029 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
PRDM2Q13029 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC41.11■■■■■ 4.17
PRDM2Q13029 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
PRDM2Q13029 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
PRDM2Q13029 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
PRDM2Q13029 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
PRDM2Q13029 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
PRDM2Q13029 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
PRDM2Q13029 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
PRDM2Q13029 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.17
PRDM2Q13029 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC41.07■■■■■ 4.17
PRDM2Q13029 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
PRDM2Q13029 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.16
PRDM2Q13029 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
PRDM2Q13029 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
PRDM2Q13029 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
PRDM2Q13029 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
PRDM2Q13029 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
PRDM2Q13029 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
PRDM2Q13029 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC41.04■■■■■ 4.16
PRDM2Q13029 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC41.04■■■■■ 4.16
PRDM2Q13029 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
PRDM2Q13029 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
PRDM2Q13029 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
PRDM2Q13029 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC41.03■■■■■ 4.16
PRDM2Q13029 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
PRDM2Q13029 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
PRDM2Q13029 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
PRDM2Q13029 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
PRDM2Q13029 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC41.01■■■■■ 4.16
PRDM2Q13029 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
PRDM2Q13029 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
PRDM2Q13029 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC41■■■■■ 4.15
PRDM2Q13029 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC41■■■■■ 4.15
PRDM2Q13029 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
PRDM2Q13029 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC40.99■■■■■ 4.15
PRDM2Q13029 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC40.99■■■■■ 4.15
PRDM2Q13029 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
PRDM2Q13029 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
PRDM2Q13029 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
PRDM2Q13029 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
PRDM2Q13029 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
PRDM2Q13029 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
PRDM2Q13029 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
PRDM2Q13029 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
PRDM2Q13029 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
PRDM2Q13029 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
PRDM2Q13029 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC40.96■■■■■ 4.15
PRDM2Q13029 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
PRDM2Q13029 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
PRDM2Q13029 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.95■■■■■ 4.15
PRDM2Q13029 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC40.95■■■■■ 4.15
PRDM2Q13029 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
PRDM2Q13029 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
PRDM2Q13029 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
PRDM2Q13029 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
PRDM2Q13029 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.92■■■■■ 4.14
PRDM2Q13029 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC40.92■■■■■ 4.14
PRDM2Q13029 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
PRDM2Q13029 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
PRDM2Q13029 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
PRDM2Q13029 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
PRDM2Q13029 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
PRDM2Q13029 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
PRDM2Q13029 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
PRDM2Q13029 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC40.9■■■■■ 4.14
PRDM2Q13029 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC40.9■■■■■ 4.14
PRDM2Q13029 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
PRDM2Q13029 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC40.89■■■■■ 4.14
PRDM2Q13029 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.89■■■■■ 4.14
PRDM2Q13029 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
PRDM2Q13029 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
PRDM2Q13029 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
PRDM2Q13029 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
PRDM2Q13029 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
PRDM2Q13029 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
PRDM2Q13029 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
PRDM2Q13029 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.13
PRDM2Q13029 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
PRDM2Q13029 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
PRDM2Q13029 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
PRDM2Q13029 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC40.87■■■■■ 4.13
PRDM2Q13029 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
PRDM2Q13029 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
PRDM2Q13029 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC40.86■■■■■ 4.13
PRDM2Q13029 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
PRDM2Q13029 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.85■■■■■ 4.13
PRDM2Q13029 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
PRDM2Q13029 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC40.85■■■■■ 4.13
PRDM2Q13029 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
PRDM2Q13029 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
PRDM2Q13029 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
PRDM2Q13029 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC40.82■■■■■ 4.13
PRDM2Q13029 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.82■■■■■ 4.12
PRDM2Q13029 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
PRDM2Q13029 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
PRDM2Q13029 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC40.81■■■■■ 4.12
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