Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFX1Q12986 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFX1Q12986 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NFX1Q12986 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NFX1Q12986 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFX1Q12986 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFX1Q12986 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NFX1Q12986 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFX1Q12986 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NFX1Q12986 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFX1Q12986 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFX1Q12986 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NFX1Q12986 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NFX1Q12986 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFX1Q12986 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFX1Q12986 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NFX1Q12986 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFX1Q12986 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFX1Q12986 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFX1Q12986 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFX1Q12986 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFX1Q12986 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFX1Q12986 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NFX1Q12986 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NFX1Q12986 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFX1Q12986 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFX1Q12986 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFX1Q12986 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFX1Q12986 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NFX1Q12986 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFX1Q12986 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFX1Q12986 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFX1Q12986 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFX1Q12986 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFX1Q12986 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFX1Q12986 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFX1Q12986 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NFX1Q12986 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFX1Q12986 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFX1Q12986 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFX1Q12986 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFX1Q12986 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFX1Q12986 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFX1Q12986 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFX1Q12986 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NFX1Q12986 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFX1Q12986 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFX1Q12986 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFX1Q12986 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFX1Q12986 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NFX1Q12986 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFX1Q12986 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NFX1Q12986 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFX1Q12986 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFX1Q12986 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
NFX1Q12986 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFX1Q12986 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NFX1Q12986 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NFX1Q12986 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
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