Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
CPSF1Q10570 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
CPSF1Q10570 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CPSF1Q10570 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CPSF1Q10570 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CPSF1Q10570 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CPSF1Q10570 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CPSF1Q10570 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CPSF1Q10570 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
CPSF1Q10570 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CPSF1Q10570 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CPSF1Q10570 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CPSF1Q10570 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CPSF1Q10570 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
CPSF1Q10570 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CPSF1Q10570 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CPSF1Q10570 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CPSF1Q10570 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CPSF1Q10570 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CPSF1Q10570 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CPSF1Q10570 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CPSF1Q10570 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CPSF1Q10570 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CPSF1Q10570 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CPSF1Q10570 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CPSF1Q10570 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CPSF1Q10570 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CPSF1Q10570 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CPSF1Q10570 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CPSF1Q10570 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CPSF1Q10570 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CPSF1Q10570 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CPSF1Q10570 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CPSF1Q10570 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
CPSF1Q10570 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CPSF1Q10570 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CPSF1Q10570 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CPSF1Q10570 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CPSF1Q10570 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CPSF1Q10570 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CPSF1Q10570 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CPSF1Q10570 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CPSF1Q10570 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
CPSF1Q10570 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CPSF1Q10570 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
CPSF1Q10570 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CPSF1Q10570 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CPSF1Q10570 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CPSF1Q10570 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CPSF1Q10570 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CPSF1Q10570 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CPSF1Q10570 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CPSF1Q10570 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CPSF1Q10570 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CPSF1Q10570 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CPSF1Q10570 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CPSF1Q10570 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
CPSF1Q10570 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CPSF1Q10570 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CPSF1Q10570 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CPSF1Q10570 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CPSF1Q10570 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CPSF1Q10570 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CPSF1Q10570 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CPSF1Q10570 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CPSF1Q10570 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
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