Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CSTF1Q05048 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CSTF1Q05048 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSTF1Q05048 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSTF1Q05048 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSTF1Q05048 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CSTF1Q05048 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSTF1Q05048 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSTF1Q05048 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CSTF1Q05048 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSTF1Q05048 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CSTF1Q05048 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSTF1Q05048 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CSTF1Q05048 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CSTF1Q05048 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSTF1Q05048 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSTF1Q05048 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSTF1Q05048 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSTF1Q05048 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CSTF1Q05048 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CSTF1Q05048 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CSTF1Q05048 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CSTF1Q05048 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSTF1Q05048 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CSTF1Q05048 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CSTF1Q05048 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSTF1Q05048 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSTF1Q05048 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSTF1Q05048 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSTF1Q05048 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CSTF1Q05048 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSTF1Q05048 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSTF1Q05048 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CSTF1Q05048 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSTF1Q05048 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSTF1Q05048 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CSTF1Q05048 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSTF1Q05048 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSTF1Q05048 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSTF1Q05048 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSTF1Q05048 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CSTF1Q05048 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSTF1Q05048 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSTF1Q05048 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSTF1Q05048 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CSTF1Q05048 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSTF1Q05048 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSTF1Q05048 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSTF1Q05048 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSTF1Q05048 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSTF1Q05048 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CSTF1Q05048 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSTF1Q05048 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSTF1Q05048 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSTF1Q05048 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSTF1Q05048 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CSTF1Q05048 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSTF1Q05048 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSTF1Q05048 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSTF1Q05048 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSTF1Q05048 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CSTF1Q05048 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CSTF1Q05048 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms