Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
OC90Q02509 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OC90Q02509 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OC90Q02509 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OC90Q02509 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OC90Q02509 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
OC90Q02509 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OC90Q02509 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OC90Q02509 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OC90Q02509 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OC90Q02509 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OC90Q02509 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
OC90Q02509 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
OC90Q02509 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OC90Q02509 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
OC90Q02509 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
OC90Q02509 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
OC90Q02509 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
OC90Q02509 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
OC90Q02509 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
OC90Q02509 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
OC90Q02509 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
OC90Q02509 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
OC90Q02509 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OC90Q02509 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OC90Q02509 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OC90Q02509 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
OC90Q02509 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
OC90Q02509 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
OC90Q02509 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
OC90Q02509 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OC90Q02509 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OC90Q02509 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OC90Q02509 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OC90Q02509 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OC90Q02509 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OC90Q02509 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OC90Q02509 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OC90Q02509 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OC90Q02509 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
OC90Q02509 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
OC90Q02509 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
OC90Q02509 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OC90Q02509 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OC90Q02509 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
OC90Q02509 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
OC90Q02509 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OC90Q02509 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OC90Q02509 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OC90Q02509 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OC90Q02509 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OC90Q02509 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
OC90Q02509 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OC90Q02509 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
OC90Q02509 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
OC90Q02509 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
OC90Q02509 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
OC90Q02509 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OC90Q02509 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
OC90Q02509 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OC90Q02509 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
OC90Q02509 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
OC90Q02509 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
OC90Q02509 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
OC90Q02509 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
OC90Q02509 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
OC90Q02509 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
OC90Q02509 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
OC90Q02509 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
OC90Q02509 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OC90Q02509 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OC90Q02509 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OC90Q02509 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
OC90Q02509 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OC90Q02509 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OC90Q02509 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OC90Q02509 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OC90Q02509 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OC90Q02509 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OC90Q02509 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OC90Q02509 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OC90Q02509 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
OC90Q02509 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
OC90Q02509 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OC90Q02509 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OC90Q02509 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OC90Q02509 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OC90Q02509 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OC90Q02509 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OC90Q02509 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OC90Q02509 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OC90Q02509 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OC90Q02509 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OC90Q02509 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OC90Q02509 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OC90Q02509 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OC90Q02509 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OC90Q02509 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OC90Q02509 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
OC90Q02509 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms