Protein–RNA interactions for Protein: Q02252

ALDH6A1, Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH6A1Q02252 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ALDH6A1Q02252 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ALDH6A1Q02252 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ALDH6A1Q02252 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH6A1Q02252 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH6A1Q02252 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH6A1Q02252 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH6A1Q02252 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ALDH6A1Q02252 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms