Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTN2Q02246 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTN2Q02246 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTN2Q02246 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTN2Q02246 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNTN2Q02246 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNTN2Q02246 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNTN2Q02246 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNTN2Q02246 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTN2Q02246 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTN2Q02246 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTN2Q02246 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTN2Q02246 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTN2Q02246 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTN2Q02246 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTN2Q02246 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTN2Q02246 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTN2Q02246 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CNTN2Q02246 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CNTN2Q02246 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CNTN2Q02246 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CNTN2Q02246 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CNTN2Q02246 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CNTN2Q02246 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTN2Q02246 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms