Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TUBA4AP68366 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TUBA4AP68366 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms