Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AP3S2P59780 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
AP3S2P59780 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3S2P59780 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3S2P59780 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3S2P59780 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3S2P59780 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3S2P59780 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP3S2P59780 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3S2P59780 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3S2P59780 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3S2P59780 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3S2P59780 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3S2P59780 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3S2P59780 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3S2P59780 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3S2P59780 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
AP3S2P59780 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3S2P59780 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3S2P59780 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3S2P59780 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
AP3S2P59780 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3S2P59780 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3S2P59780 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3S2P59780 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3S2P59780 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3S2P59780 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
AP3S2P59780 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms