Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CACNA2D1P54289 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA2D1P54289 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA2D1P54289 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA2D1P54289 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA2D1P54289 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA2D1P54289 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CACNA2D1P54289 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA2D1P54289 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA2D1P54289 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA2D1P54289 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA2D1P54289 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA2D1P54289 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA2D1P54289 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA2D1P54289 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CACNA2D1P54289 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA2D1P54289 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA2D1P54289 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA2D1P54289 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA2D1P54289 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CACNA2D1P54289 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA2D1P54289 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA2D1P54289 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA2D1P54289 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA2D1P54289 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA2D1P54289 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA2D1P54289 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA2D1P54289 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CACNA2D1P54289 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA2D1P54289 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CACNA2D1P54289 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA2D1P54289 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA2D1P54289 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA2D1P54289 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA2D1P54289 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA2D1P54289 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA2D1P54289 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CACNA2D1P54289 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CACNA2D1P54289 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms