Protein–RNA interactions for Protein: P52435

POLR2J, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2JP52435 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
POLR2JP52435 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
POLR2JP52435 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
POLR2JP52435 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms