Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
TNNI2P48788 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNNI2P48788 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNNI2P48788 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNNI2P48788 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TNNI2P48788 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNNI2P48788 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNNI2P48788 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNNI2P48788 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNNI2P48788 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNNI2P48788 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNNI2P48788 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TNNI2P48788 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNNI2P48788 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNNI2P48788 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNNI2P48788 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNNI2P48788 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TNNI2P48788 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNNI2P48788 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNNI2P48788 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TNNI2P48788 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNNI2P48788 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNNI2P48788 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNNI2P48788 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNNI2P48788 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNNI2P48788 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNNI2P48788 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNNI2P48788 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TNNI2P48788 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNNI2P48788 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNNI2P48788 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNNI2P48788 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TNNI2P48788 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
TNNI2P48788 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TNNI2P48788 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TNNI2P48788 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNNI2P48788 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNNI2P48788 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNNI2P48788 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TNNI2P48788 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNI2P48788 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNI2P48788 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNI2P48788 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNI2P48788 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNI2P48788 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TNNI2P48788 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNI2P48788 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNI2P48788 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNI2P48788 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNI2P48788 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TNNI2P48788 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNI2P48788 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNI2P48788 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNI2P48788 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNI2P48788 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNI2P48788 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNI2P48788 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNI2P48788 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNI2P48788 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TNNI2P48788 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNNI2P48788 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TNNI2P48788 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNI2P48788 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNI2P48788 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNI2P48788 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNI2P48788 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNI2P48788 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNI2P48788 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TNNI2P48788 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNNI2P48788 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNNI2P48788 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TNNI2P48788 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TNNI2P48788 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms