Protein–RNA interactions for Protein: P42830

CXCL5, C-X-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL5P42830 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CXCL5P42830 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CXCL5P42830 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL5P42830 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL5P42830 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL5P42830 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL5P42830 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CXCL5P42830 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms