Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
KDM5CP41229 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
KDM5CP41229 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
KDM5CP41229 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
KDM5CP41229 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
KDM5CP41229 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
KDM5CP41229 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
KDM5CP41229 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
KDM5CP41229 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
KDM5CP41229 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
KDM5CP41229 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
KDM5CP41229 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
KDM5CP41229 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
KDM5CP41229 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
KDM5CP41229 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC36.02■■■■□ 3.36
KDM5CP41229 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
KDM5CP41229 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
KDM5CP41229 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
KDM5CP41229 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
KDM5CP41229 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
KDM5CP41229 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
KDM5CP41229 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
KDM5CP41229 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
KDM5CP41229 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
KDM5CP41229 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
KDM5CP41229 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
KDM5CP41229 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
KDM5CP41229 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
KDM5CP41229 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
KDM5CP41229 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
KDM5CP41229 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
KDM5CP41229 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
KDM5CP41229 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
KDM5CP41229 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
KDM5CP41229 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
KDM5CP41229 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
KDM5CP41229 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
KDM5CP41229 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
KDM5CP41229 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
KDM5CP41229 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
KDM5CP41229 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
KDM5CP41229 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
KDM5CP41229 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
KDM5CP41229 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
KDM5CP41229 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
KDM5CP41229 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
KDM5CP41229 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC35.97■■■■□ 3.35
KDM5CP41229 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC35.97■■■■□ 3.35
KDM5CP41229 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
KDM5CP41229 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
KDM5CP41229 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
KDM5CP41229 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
KDM5CP41229 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC35.96■■■■□ 3.35
KDM5CP41229 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
KDM5CP41229 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
KDM5CP41229 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
KDM5CP41229 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
KDM5CP41229 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
KDM5CP41229 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
KDM5CP41229 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
KDM5CP41229 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
KDM5CP41229 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
KDM5CP41229 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC35.93■■■■□ 3.34
KDM5CP41229 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
KDM5CP41229 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
KDM5CP41229 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
KDM5CP41229 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
KDM5CP41229 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
KDM5CP41229 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
KDM5CP41229 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
KDM5CP41229 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
KDM5CP41229 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
KDM5CP41229 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
KDM5CP41229 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
KDM5CP41229 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC35.89■■■■□ 3.34
KDM5CP41229 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
KDM5CP41229 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
KDM5CP41229 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
KDM5CP41229 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
KDM5CP41229 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
KDM5CP41229 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC35.86■■■■□ 3.33
KDM5CP41229 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
KDM5CP41229 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
KDM5CP41229 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
KDM5CP41229 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
KDM5CP41229 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
KDM5CP41229 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
KDM5CP41229 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC35.85■■■■□ 3.33
KDM5CP41229 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
KDM5CP41229 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
KDM5CP41229 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
KDM5CP41229 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
KDM5CP41229 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
KDM5CP41229 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
KDM5CP41229 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC35.82■■■■□ 3.32
KDM5CP41229 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
KDM5CP41229 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
KDM5CP41229 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
KDM5CP41229 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
KDM5CP41229 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC35.81■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms