Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
TM4SF1P30408 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
TM4SF1P30408 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TM4SF1P30408 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TM4SF1P30408 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
TM4SF1P30408 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TM4SF1P30408 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TM4SF1P30408 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
TM4SF1P30408 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TM4SF1P30408 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
TM4SF1P30408 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TM4SF1P30408 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TM4SF1P30408 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TM4SF1P30408 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TM4SF1P30408 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TM4SF1P30408 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TM4SF1P30408 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TM4SF1P30408 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TM4SF1P30408 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
TM4SF1P30408 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TM4SF1P30408 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TM4SF1P30408 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TM4SF1P30408 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TM4SF1P30408 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TM4SF1P30408 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TM4SF1P30408 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TM4SF1P30408 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TM4SF1P30408 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TM4SF1P30408 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TM4SF1P30408 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TM4SF1P30408 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TM4SF1P30408 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TM4SF1P30408 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TM4SF1P30408 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.87■■■□□ 2.37
TM4SF1P30408 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TM4SF1P30408 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TM4SF1P30408 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TM4SF1P30408 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
TM4SF1P30408 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
TM4SF1P30408 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TM4SF1P30408 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TM4SF1P30408 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TM4SF1P30408 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TM4SF1P30408 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TM4SF1P30408 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TM4SF1P30408 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TM4SF1P30408 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TM4SF1P30408 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TM4SF1P30408 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TM4SF1P30408 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TM4SF1P30408 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TM4SF1P30408 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TM4SF1P30408 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TM4SF1P30408 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TM4SF1P30408 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TM4SF1P30408 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TM4SF1P30408 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TM4SF1P30408 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TM4SF1P30408 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
TM4SF1P30408 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TM4SF1P30408 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TM4SF1P30408 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TM4SF1P30408 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TM4SF1P30408 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TM4SF1P30408 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TM4SF1P30408 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TM4SF1P30408 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
TM4SF1P30408 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TM4SF1P30408 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TM4SF1P30408 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TM4SF1P30408 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TM4SF1P30408 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TM4SF1P30408 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TM4SF1P30408 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TM4SF1P30408 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TM4SF1P30408 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TM4SF1P30408 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TM4SF1P30408 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TM4SF1P30408 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TM4SF1P30408 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TM4SF1P30408 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TM4SF1P30408 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TM4SF1P30408 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TM4SF1P30408 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TM4SF1P30408 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TM4SF1P30408 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
TM4SF1P30408 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TM4SF1P30408 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TM4SF1P30408 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TM4SF1P30408 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TM4SF1P30408 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TM4SF1P30408 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TM4SF1P30408 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TM4SF1P30408 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TM4SF1P30408 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TM4SF1P30408 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TM4SF1P30408 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.5 ms