Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ITGA3P26006 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ITGA3P26006 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA3P26006 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms