Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTGS1P23219 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTGS1P23219 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTGS1P23219 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTGS1P23219 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTGS1P23219 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTGS1P23219 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTGS1P23219 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTGS1P23219 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
PTGS1P23219 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PTGS1P23219 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTGS1P23219 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTGS1P23219 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTGS1P23219 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PTGS1P23219 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PTGS1P23219 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PTGS1P23219 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTGS1P23219 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTGS1P23219 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTGS1P23219 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTGS1P23219 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTGS1P23219 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTGS1P23219 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTGS1P23219 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTGS1P23219 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTGS1P23219 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTGS1P23219 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTGS1P23219 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTGS1P23219 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTGS1P23219 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTGS1P23219 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PTGS1P23219 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTGS1P23219 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTGS1P23219 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTGS1P23219 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGS1P23219 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGS1P23219 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGS1P23219 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTGS1P23219 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTGS1P23219 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTGS1P23219 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTGS1P23219 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTGS1P23219 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
PTGS1P23219 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTGS1P23219 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTGS1P23219 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PTGS1P23219 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTGS1P23219 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTGS1P23219 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTGS1P23219 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTGS1P23219 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTGS1P23219 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTGS1P23219 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTGS1P23219 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTGS1P23219 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTGS1P23219 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTGS1P23219 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTGS1P23219 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms