Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
LMNB1P20700 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LMNB1P20700 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LMNB1P20700 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
LMNB1P20700 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMNB1P20700 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
LMNB1P20700 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMNB1P20700 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMNB1P20700 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMNB1P20700 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LMNB1P20700 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
LMNB1P20700 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMNB1P20700 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
LMNB1P20700 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMNB1P20700 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
LMNB1P20700 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LMNB1P20700 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMNB1P20700 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LMNB1P20700 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMNB1P20700 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMNB1P20700 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMNB1P20700 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMNB1P20700 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMNB1P20700 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
LMNB1P20700 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMNB1P20700 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMNB1P20700 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
LMNB1P20700 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMNB1P20700 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMNB1P20700 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
LMNB1P20700 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LMNB1P20700 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMNB1P20700 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMNB1P20700 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMNB1P20700 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LMNB1P20700 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LMNB1P20700 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
LMNB1P20700 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMNB1P20700 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LMNB1P20700 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
LMNB1P20700 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMNB1P20700 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMNB1P20700 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMNB1P20700 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMNB1P20700 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
LMNB1P20700 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMNB1P20700 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMNB1P20700 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMNB1P20700 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMNB1P20700 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
LMNB1P20700 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMNB1P20700 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMNB1P20700 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
LMNB1P20700 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
LMNB1P20700 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMNB1P20700 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMNB1P20700 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LMNB1P20700 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
LMNB1P20700 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LMNB1P20700 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LMNB1P20700 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LMNB1P20700 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LMNB1P20700 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
LMNB1P20700 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LMNB1P20700 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
LMNB1P20700 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LMNB1P20700 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
LMNB1P20700 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMNB1P20700 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMNB1P20700 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
LMNB1P20700 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
LMNB1P20700 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LMNB1P20700 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
LMNB1P20700 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMNB1P20700 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMNB1P20700 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMNB1P20700 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMNB1P20700 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LMNB1P20700 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMNB1P20700 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LMNB1P20700 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
LMNB1P20700 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
LMNB1P20700 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
LMNB1P20700 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
LMNB1P20700 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMNB1P20700 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMNB1P20700 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMNB1P20700 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMNB1P20700 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMNB1P20700 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LMNB1P20700 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMNB1P20700 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMNB1P20700 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMNB1P20700 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
LMNB1P20700 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMNB1P20700 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
LMNB1P20700 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 973 ms