Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYN1P17600 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYN1P17600 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYN1P17600 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYN1P17600 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYN1P17600 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYN1P17600 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYN1P17600 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYN1P17600 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYN1P17600 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYN1P17600 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYN1P17600 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYN1P17600 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SYN1P17600 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYN1P17600 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYN1P17600 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYN1P17600 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYN1P17600 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SYN1P17600 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYN1P17600 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYN1P17600 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYN1P17600 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SYN1P17600 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SYN1P17600 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYN1P17600 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYN1P17600 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYN1P17600 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYN1P17600 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SYN1P17600 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYN1P17600 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYN1P17600 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SYN1P17600 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SYN1P17600 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYN1P17600 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYN1P17600 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYN1P17600 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYN1P17600 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYN1P17600 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SYN1P17600 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SYN1P17600 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYN1P17600 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SYN1P17600 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYN1P17600 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYN1P17600 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SYN1P17600 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYN1P17600 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYN1P17600 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYN1P17600 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SYN1P17600 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYN1P17600 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYN1P17600 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SYN1P17600 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYN1P17600 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYN1P17600 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYN1P17600 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SYN1P17600 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYN1P17600 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYN1P17600 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYN1P17600 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYN1P17600 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SYN1P17600 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SYN1P17600 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYN1P17600 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SYN1P17600 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYN1P17600 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYN1P17600 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
SYN1P17600 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SYN1P17600 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYN1P17600 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYN1P17600 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYN1P17600 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SYN1P17600 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SYN1P17600 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYN1P17600 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYN1P17600 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYN1P17600 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYN1P17600 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SYN1P17600 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYN1P17600 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SYN1P17600 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYN1P17600 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYN1P17600 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYN1P17600 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYN1P17600 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYN1P17600 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYN1P17600 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYN1P17600 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SYN1P17600 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SYN1P17600 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYN1P17600 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYN1P17600 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYN1P17600 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SYN1P17600 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
SYN1P17600 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYN1P17600 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SYN1P17600 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYN1P17600 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYN1P17600 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SYN1P17600 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SYN1P17600 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms