Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCL5P13501 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCL5P13501 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCL5P13501 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCL5P13501 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCL5P13501 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCL5P13501 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCL5P13501 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCL5P13501 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CCL5P13501 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCL5P13501 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCL5P13501 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCL5P13501 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCL5P13501 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCL5P13501 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCL5P13501 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCL5P13501 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCL5P13501 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCL5P13501 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCL5P13501 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCL5P13501 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCL5P13501 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCL5P13501 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCL5P13501 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCL5P13501 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCL5P13501 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCL5P13501 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCL5P13501 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CCL5P13501 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCL5P13501 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCL5P13501 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCL5P13501 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCL5P13501 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCL5P13501 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCL5P13501 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CCL5P13501 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCL5P13501 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCL5P13501 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCL5P13501 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCL5P13501 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCL5P13501 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCL5P13501 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCL5P13501 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CCL5P13501 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCL5P13501 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCL5P13501 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCL5P13501 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCL5P13501 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CCL5P13501 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CCL5P13501 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCL5P13501 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCL5P13501 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCL5P13501 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCL5P13501 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCL5P13501 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCL5P13501 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCL5P13501 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCL5P13501 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCL5P13501 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
CCL5P13501 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCL5P13501 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCL5P13501 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCL5P13501 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCL5P13501 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCL5P13501 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCL5P13501 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCL5P13501 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCL5P13501 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCL5P13501 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCL5P13501 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCL5P13501 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCL5P13501 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCL5P13501 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCL5P13501 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCL5P13501 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCL5P13501 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCL5P13501 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCL5P13501 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCL5P13501 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCL5P13501 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCL5P13501 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCL5P13501 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCL5P13501 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCL5P13501 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCL5P13501 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
CCL5P13501 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCL5P13501 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCL5P13501 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCL5P13501 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCL5P13501 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCL5P13501 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCL5P13501 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCL5P13501 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCL5P13501 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCL5P13501 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCL5P13501 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCL5P13501 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCL5P13501 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCL5P13501 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCL5P13501 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms