Protein–RNA interactions for Protein: P12081

HARS, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARSP12081 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HARSP12081 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HARSP12081 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HARSP12081 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HARSP12081 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HARSP12081 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HARSP12081 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
HARSP12081 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HARSP12081 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HARSP12081 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HARSP12081 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HARSP12081 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HARSP12081 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HARSP12081 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HARSP12081 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HARSP12081 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HARSP12081 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HARSP12081 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HARSP12081 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HARSP12081 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HARSP12081 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HARSP12081 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HARSP12081 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HARSP12081 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HARSP12081 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HARSP12081 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HARSP12081 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HARSP12081 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HARSP12081 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HARSP12081 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HARSP12081 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HARSP12081 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HARSP12081 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HARSP12081 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HARSP12081 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HARSP12081 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HARSP12081 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HARSP12081 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HARSP12081 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HARSP12081 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HARSP12081 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HARSP12081 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HARSP12081 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
HARSP12081 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HARSP12081 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HARSP12081 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
HARSP12081 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HARSP12081 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HARSP12081 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HARSP12081 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HARSP12081 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HARSP12081 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HARSP12081 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HARSP12081 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HARSP12081 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HARSP12081 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HARSP12081 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HARSP12081 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HARSP12081 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
HARSP12081 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HARSP12081 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HARSP12081 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HARSP12081 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HARSP12081 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HARSP12081 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HARSP12081 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HARSP12081 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HARSP12081 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HARSP12081 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HARSP12081 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HARSP12081 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HARSP12081 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HARSP12081 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HARSP12081 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HARSP12081 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HARSP12081 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HARSP12081 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HARSP12081 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HARSP12081 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HARSP12081 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HARSP12081 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HARSP12081 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HARSP12081 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HARSP12081 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HARSP12081 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
HARSP12081 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HARSP12081 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HARSP12081 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HARSP12081 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HARSP12081 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HARSP12081 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HARSP12081 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HARSP12081 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HARSP12081 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HARSP12081 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HARSP12081 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HARSP12081 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HARSP12081 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HARSP12081 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HARSP12081 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms