Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM225BP0DP42 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TMEM225BP0DP42 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TMEM225BP0DP42 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms