Protein–RNA interactions for Protein: P0C221

CCDC175, Coiled-coil domain-containing protein 175, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC175P0C221 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC175P0C221 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC175P0C221 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC175P0C221 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC175P0C221 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC175P0C221 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC175P0C221 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC175P0C221 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC175P0C221 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC175P0C221 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC175P0C221 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC175P0C221 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC175P0C221 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC175P0C221 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC175P0C221 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC175P0C221 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC175P0C221 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC175P0C221 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC175P0C221 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC175P0C221 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC175P0C221 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC175P0C221 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC175P0C221 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC175P0C221 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC175P0C221 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC175P0C221 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC175P0C221 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC175P0C221 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC175P0C221 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC175P0C221 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC175P0C221 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC175P0C221 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC175P0C221 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC175P0C221 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC175P0C221 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC175P0C221 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC175P0C221 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC175P0C221 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC175P0C221 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC175P0C221 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC175P0C221 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC175P0C221 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC175P0C221 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC175P0C221 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC175P0C221 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC175P0C221 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC175P0C221 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC175P0C221 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC175P0C221 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC175P0C221 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC175P0C221 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC175P0C221 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC175P0C221 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC175P0C221 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC175P0C221 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC175P0C221 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC175P0C221 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC175P0C221 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC175P0C221 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC175P0C221 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC175P0C221 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC175P0C221 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC175P0C221 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC175P0C221 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC175P0C221 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC175P0C221 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC175P0C221 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC175P0C221 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC175P0C221 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC175P0C221 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC175P0C221 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC175P0C221 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC175P0C221 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC175P0C221 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC175P0C221 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms