Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
MMP10P09238 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MMP10P09238 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MMP10P09238 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MMP10P09238 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
MMP10P09238 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MMP10P09238 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MMP10P09238 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
MMP10P09238 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MMP10P09238 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MMP10P09238 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MMP10P09238 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
MMP10P09238 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
MMP10P09238 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MMP10P09238 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
MMP10P09238 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MMP10P09238 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
MMP10P09238 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
MMP10P09238 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MMP10P09238 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MMP10P09238 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MMP10P09238 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MMP10P09238 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
MMP10P09238 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
MMP10P09238 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MMP10P09238 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MMP10P09238 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MMP10P09238 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
MMP10P09238 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
MMP10P09238 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
MMP10P09238 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MMP10P09238 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
MMP10P09238 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MMP10P09238 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
MMP10P09238 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
MMP10P09238 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MMP10P09238 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MMP10P09238 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
MMP10P09238 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MMP10P09238 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
MMP10P09238 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
MMP10P09238 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
MMP10P09238 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
MMP10P09238 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MMP10P09238 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
MMP10P09238 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
MMP10P09238 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MMP10P09238 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MMP10P09238 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MMP10P09238 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
MMP10P09238 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MMP10P09238 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
MMP10P09238 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
MMP10P09238 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MMP10P09238 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
MMP10P09238 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
MMP10P09238 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
MMP10P09238 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
MMP10P09238 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
MMP10P09238 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MMP10P09238 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MMP10P09238 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
MMP10P09238 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MMP10P09238 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MMP10P09238 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
MMP10P09238 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MMP10P09238 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MMP10P09238 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MMP10P09238 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MMP10P09238 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
MMP10P09238 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MMP10P09238 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
MMP10P09238 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MMP10P09238 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MMP10P09238 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
MMP10P09238 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MMP10P09238 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MMP10P09238 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MMP10P09238 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MMP10P09238 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MMP10P09238 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MMP10P09238 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC29.78■■■□□ 2.36
MMP10P09238 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
MMP10P09238 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
MMP10P09238 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
MMP10P09238 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MMP10P09238 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MMP10P09238 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MMP10P09238 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
MMP10P09238 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
MMP10P09238 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
MMP10P09238 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
MMP10P09238 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MMP10P09238 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MMP10P09238 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
MMP10P09238 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MMP10P09238 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
MMP10P09238 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
MMP10P09238 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
MMP10P09238 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms