Protein–RNA interactions for Protein: P03372

ESR1, Estrogen receptor, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESR1P03372 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ESR1P03372 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ESR1P03372 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ESR1P03372 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ESR1P03372 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ESR1P03372 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ESR1P03372 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ESR1P03372 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ESR1P03372 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ESR1P03372 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ESR1P03372 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ESR1P03372 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ESR1P03372 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ESR1P03372 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ESR1P03372 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ESR1P03372 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ESR1P03372 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ESR1P03372 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ESR1P03372 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ESR1P03372 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ESR1P03372 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ESR1P03372 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ESR1P03372 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ESR1P03372 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ESR1P03372 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ESR1P03372 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ESR1P03372 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ESR1P03372 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ESR1P03372 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ESR1P03372 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ESR1P03372 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ESR1P03372 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ESR1P03372 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ESR1P03372 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ESR1P03372 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ESR1P03372 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ESR1P03372 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ESR1P03372 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ESR1P03372 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ESR1P03372 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ESR1P03372 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ESR1P03372 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ESR1P03372 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ESR1P03372 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ESR1P03372 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ESR1P03372 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
ESR1P03372 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ESR1P03372 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ESR1P03372 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ESR1P03372 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ESR1P03372 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ESR1P03372 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ESR1P03372 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ESR1P03372 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ESR1P03372 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ESR1P03372 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ESR1P03372 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ESR1P03372 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ESR1P03372 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ESR1P03372 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ESR1P03372 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ESR1P03372 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ESR1P03372 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ESR1P03372 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ESR1P03372 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ESR1P03372 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ESR1P03372 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ESR1P03372 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ESR1P03372 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ESR1P03372 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ESR1P03372 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ESR1P03372 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ESR1P03372 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ESR1P03372 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ESR1P03372 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ESR1P03372 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ESR1P03372 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ESR1P03372 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ESR1P03372 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ESR1P03372 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ESR1P03372 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ESR1P03372 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ESR1P03372 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ESR1P03372 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ESR1P03372 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ESR1P03372 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ESR1P03372 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ESR1P03372 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ESR1P03372 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ESR1P03372 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ESR1P03372 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ESR1P03372 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ESR1P03372 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ESR1P03372 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ESR1P03372 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ESR1P03372 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ESR1P03372 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ESR1P03372 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ESR1P03372 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ESR1P03372 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms