Protein–RNA interactions for Protein: O95425

SVIL, Supervillin, humanhuman

Predictions only

Length 2,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVILO95425 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SVILO95425 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SVILO95425 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SVILO95425 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SVILO95425 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SVILO95425 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SVILO95425 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SVILO95425 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SVILO95425 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SVILO95425 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SVILO95425 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SVILO95425 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SVILO95425 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SVILO95425 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SVILO95425 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SVILO95425 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SVILO95425 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SVILO95425 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SVILO95425 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SVILO95425 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SVILO95425 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SVILO95425 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SVILO95425 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SVILO95425 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SVILO95425 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SVILO95425 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SVILO95425 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SVILO95425 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SVILO95425 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SVILO95425 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SVILO95425 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SVILO95425 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SVILO95425 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SVILO95425 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SVILO95425 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SVILO95425 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SVILO95425 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SVILO95425 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SVILO95425 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SVILO95425 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SVILO95425 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SVILO95425 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SVILO95425 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SVILO95425 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SVILO95425 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SVILO95425 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SVILO95425 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SVILO95425 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SVILO95425 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SVILO95425 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SVILO95425 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SVILO95425 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SVILO95425 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SVILO95425 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SVILO95425 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
SVILO95425 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
SVILO95425 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SVILO95425 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SVILO95425 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SVILO95425 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SVILO95425 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SVILO95425 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SVILO95425 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SVILO95425 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SVILO95425 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SVILO95425 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SVILO95425 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SVILO95425 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SVILO95425 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SVILO95425 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SVILO95425 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.31■■□□□ 1
SVILO95425 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SVILO95425 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SVILO95425 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SVILO95425 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SVILO95425 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SVILO95425 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SVILO95425 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SVILO95425 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SVILO95425 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SVILO95425 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SVILO95425 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SVILO95425 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SVILO95425 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SVILO95425 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SVILO95425 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SVILO95425 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SVILO95425 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SVILO95425 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SVILO95425 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SVILO95425 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SVILO95425 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SVILO95425 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SVILO95425 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SVILO95425 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SVILO95425 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SVILO95425 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SVILO95425 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SVILO95425 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SVILO95425 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms